肩胛骨部位疼痛，可能是由于颈椎病、肩部的肌肉劳损、肩周炎，或者是肝胆疾病、心脏疾病等原因造成，所以当出现肩胛骨部位疼痛的时候，对于药物治疗，主要是针对病因对症应用药治疗。

例如，如果是颈椎病引起的疼痛，主要是应用非甾体类抗炎镇痛的药物缓解疼痛，当出现其他症状的时候，也可以应用营养软骨的药物、营养神经的药物等药物改善症状，或者配合热敷、理疗、牵引等方法治疗，对于改善症状能起到一定的作用。对于其他原因引起的肩胛骨疼痛，也需要根据病情对症用药治疗。

（药物的使用应在医生指导下进行）