目前关于引起甲状腺癌的一些病因尚不是很明确，有研究表示分化型的甲状腺癌，比如说乳头状癌、滤泡癌的发病机制也是不完全清楚的，考虑可能是与染色体的异常和多个基因的异常有关系。比如甲状腺髓样癌有散发性和遗传性两种，像遗传性的患者，是有一个RET的原癌基因的，甚至与细胞突变有关系。

当然，除了基因的因素以外，射线暴露是目前唯一正式的致病因素，是可以导致甲状腺癌的。

另外，还有一些甲状腺的良性的病变也可以发生一些癌性病变，还有比如说女性的一些生殖因素，以及碘、饮食、体重、职业、药物和吸烟等等很多因素都可能导致甲状腺癌的发生，目前尚不是很明确。