女性的巧克力囊肿，不管是经过手术治疗还是药物治疗之后症状改善，如果有复发的时候，以前的一些症状还会再次出现，比如最常见的痛经、慢性的盆腔疼痛，此外，有一些女性有可能其他部位也有一些内因的病灶，比如内因的病灶在道格拉斯窝，也就是盆腔的最深的部位也存在，那么还可以引起女性出现性交疼痛，

卵巢的巧克力囊肿，它会影响卵巢正常的排卵，导致女性出现月经周期的异常，比如月经量增多，月经时间延长，时间长了还可以引起女性出现失血性的贫血，引起头晕、乏力等现象，因为巧囊它可以影响正常排卵，还可以导致女性出现不孕症。