女性卵巢囊肿和多囊卵巢是不一样的。

一般来说，卵巢囊肿属于卵巢的器质性病变，而多囊卵巢大部分都和内分泌异常有一定的关系。比如说，最常见的生理性的卵巢囊肿，像排卵之后形成的黄体囊肿，还有一些病理性的，比如说炎症，或者是子宫内膜异位到卵巢上，长期如此导致的巧克力囊肿。还有的女性是卵巢的肿瘤，表现为卵巢的囊肿状态。

而多囊卵巢通常和女性内分泌异常有关，比如说正常女性偶尔也有不排卵的现象，表现为在双侧卵巢上，同时可以看到大于12个小卵泡，这个卵泡的直径一般都小于一个厘米，没有一个优势卵泡出现。一部分女性有可能合并有内分泌的异常，比如说出现了雄激素水平的升高。