结缔组织病不治疗，最严重的后果是会出现重要的内脏器官的受累，最常累及到内脏器官有肺。患者往往会出现肺间质病变，主要的临床表现是会出现活动以后的胸闷、气喘等症状。

同时结缔组织病也会累及到肾脏，常出现的临床表现会出现水肿，出现尿中的大量的蛋白尿。有些严重的结缔组织病还会累及到胃肠道而出现反复的腹痛、腹泻，严重的病人会出现肠梗阻。最严重的结缔组织病会出现脑部病变，患者会出现癫痫之类的并发症。