结节性硬化目前无特殊治疗办法，处理的重点主要是遗传咨询及早期发现可治疗的情况或者并发症，尤其是针对癫痫发作，可根据病人年龄及发作的类型，选用不同的抗癫痫病药物。由于脑部病变是多发性的，外科手术大多效果不佳，但如果肿瘤位于重要部位或者引起明显的占位病变，应该考虑手术切除，严重的癫痫发作者，也可以采取胼胝体切开术。