中枢神经系统感染这个概念是比较广的，包括了一些病毒性的感染、细菌性的感染、结核感染，还有真菌性的感染。

一般情况下，一些病毒性脑炎所导致的中枢神经系统感染，经过了正规的抗病毒治疗，大部分患者是能够治好的，仅有少数比较重的患者会留下一定程度的后遗症，比如出现智能的下降等。

细菌感染引起来的化脓性脑膜炎，随着目前抗生素的大量使用，多数患者也是能够治好的，如果患者出现了脑实质的损害，出现了一些颅神经的损害，也会留下后遗症。而真菌感染，比如隐球菌脑膜炎，预后是非常差的，患者治疗非常困难。