国内外的文献报道，子宫内膜异位症恶变的发生率在1%左右，主要就是与卵巢型的内异症相关，也就是与巧克力囊肿相关。但是由于癌组织可能破坏原发的内异症病灶，病理取材不充分，或者是病理报告不完全，都有可能导致诊断遗漏。因而内异症恶变的准确发生率很有可能被低估。内异症恶变，它的主要的组织学类型为透明细胞癌和子宫内膜样癌。目前，它的发生机制是不明确的。那么我们在下面几种情况下应该高度警惕内异症的恶变，比如说绝经后的内异症患者，疼痛的节律出现改变，还有就是卵巢巧克力囊肿的直径大于10cm，还有就是影像学检查有恶性的征象，另外就是血清肿瘤标志物Ca125水平高达200U/ml以上。