三个月的宝宝拉肚子，首先要分析引起拉肚子的原因，是受凉，还是病毒感染引起的，如果考虑这两方面的原因，可以首先给予肠道益生菌调理，比方说口服双歧杆菌或者嗜酸乳杆菌等。同时还可以给予口服补液盐，既可以补充水分，又可以补充电解质。同时还可以口服蒙脱石散保护胃肠粘膜，如果拉肚子拉得时间长，可以适当给予补充锌。如果考虑是肠道病毒感染，还可以口服一些抗病毒的药物辅助治疗。