婴儿便秘的危害主要是在以下几个方面：

首先最大的危害就是引起婴儿便秘的病因没有得到及时的确诊、治疗处理，特别是部分婴儿的便秘是因为先天性巨结肠或者肠道畸形引起的，就应该及时治疗处理，一般是看小儿外科急诊或者外科门诊。

其次，便秘的孩子时间久了，就会表现为消化吸收功能不好，长久下去可能会引起宝宝生长发育障碍。

第三个方面，便秘的孩子胃肠道积气增多了，肠蠕动异常，会使孩子感觉到生活质量的下降，比如经常感到腹部不适，容易烦躁、容易发脾气，还可能会影响宝宝的正常睡眠，得不到有效的休息，影响孩子的整体生活质量。