三岁小孩发热39度是高热，高热首先还是要给予退热处理，退热可以使用布洛芬或者对乙酰基酚，选一种口服就可以了。如果体温反复，可以间隔四到六个小时可以重复使用，同时还可以采取一些物理降温的措施。其次一定要评估病情，如果考虑是病毒感染引起的高热，对症可以考口服一些抗病毒、清热解毒的一些药物。如果考虑是细菌感染，就要抗敏感的抗生素抗感染治疗，必要的时候要静脉使用抗感染药物，边治疗边观察宝宝的情况。 必要的时候还是要上医院住院治疗。