前庭大腺囊肿由于腺口堵塞，而造成前庭大腺内分秘物无法排出，积聚在囊肿内的分泌物越来越多，可继发前庭大腺囊肿。前庭大腺囊肿的病因，也可以由病原微生物的侵入而造成，当机体抵抗力减弱时，病原微生物可经腺口进一步侵入前庭大腺内，从而引发疾病的发生。