3岁宝宝发烧39℃是一个高热，高热首先还是要退热处理，退热可以口服药物，比方说口服布洛芬或对乙酰氨基酚，体温如果反复，间隔四到六个小时可以重复使用。还可以配合物理降温，比方说温水擦浴或洗温水澡等。

同时还要查找发热的原因，比方说是病毒感染还是细菌感染，这个情况下要上医院查查血常规。如果是血象不高，病毒感染的可能性比较大。如果考虑病毒感染，可以给予一些抗病毒的药物，比方说抗病毒口服液，还有一些清热解毒的中成药。如果考虑有细菌感染，就可以加用一些敏感的抗生素口服治疗，头孢类或者青霉素类等等。