婴儿发烧了，说明存在感染，而腹泻有消化道的症状，大概率说明是消化道的感染。在感染性腹泻中，绝大部分是由肠道病毒感染引起，占了80%左右，常见的肠道病毒有轮状病毒、诺如病毒、埃可病毒、柯萨奇病毒、腺病毒等等。病毒感染性腹泻通常表现为水样的腹泻，还可能会继续发乳糖不耐受，因此大便里面奶瓣也比较多。

少部分为细菌感染性腹泻；还有部分可能是寄生虫或者肠道的真菌感染；有的孩子还可能是消化系统之外的感染，如肺炎、脓毒血症发烧，在消化道症状表现为腹泻。