大部分卵巢囊肿是不会出现腹痛的，尤其是体积较小，良性的囊肿，但是部分患者患卵巢囊肿后是会有腹痛症状的，例如子宫内膜异位囊肿又称为巧克力囊肿，巧克力囊肿严重到一定程度后，可以造成患者下腹部的疼痛，尤其疼痛可表现为经期的腹痛，当出现腹痛症状时，患者首先就诊于当地医院进行疾病检查的主要原因。