菌血症和败血症的区别在于，菌血症是指致病菌进入血液循环当中，就称之为菌血症。而败血症是指致病菌侵入到血液循环当中，还大量的生长、繁殖产生了毒素，导致了全身炎症反应，从而称之为败血症。在这个层面上来讲，败血症是要重于菌血症的。败血症是菌血症不能良好控制以后，疾病进展的一个情况。所以，菌血症和败血症只是细菌感染的不同的阶段。