相对来说，脑脓肿死亡率不高。多数脑脓肿在早期接受了有效的抗生素药物治疗效果较好，患者原有的症状或体征逐渐的缓解甚至消失，往往可以达到很好的治疗目的。若在疾病的初期，通过抗生素治疗较差，或已经形成了完整的包膜，还可以通过手术的方式来进行治疗。比如可以采用穿刺的方法，以及通过开颅手术将薄膜以及脑脓肿完整有效切除等方式来进行治疗。多数患者经过积极治疗之后，原有的症状逐渐缓解甚至消失，因此，对于脑脓肿来说相对死亡率不高。