怀孕三个月是不能做人工流产的，这是由于三个月的胚胎已经非常大了，这时候已经有骨骼生长出来，有四肢，有头颅，这么大的胎儿很难通过人工流产弄出来的，因为人工流产的时候宫颈开口不是很大，所以没有办法把这么大的胎儿从子宫腔里面弄出来。

正常情况下怀孕三个月的处理一般是住院治疗，住院以后先吃药流的药物将胚胎组织流出来，然后再给予清宫手术，这样来说比较安全，而且患者出血量也不多。