胃镜检查可以发现大部分的食管问题，比如反流性食管炎、霉菌性食管炎、食管溃疡、食道乳头状增生、食道息肉、食道静脉窦、食管裂孔疝，以及食道肿瘤；胃部疾病，比如急性胃炎、急性胃粘膜病变、慢性浅表性胃炎、慢性萎缩性胃炎、胆汁反流性胃炎、胃部肿瘤等等；十二指肠病变，如十二指肠球炎、十二指肠球部溃疡、十二指肠囊肿、十二指肠肿瘤等等。大部分上消化道疾病都是可以通过胃镜检查得到明确诊断的，部分患者可以结合超声胃镜，也能得到明确诊断，比如食管下平滑肌瘤或者间质瘤等等。