肾结核的诊断符合以下三项中的任一项则可以确诊：

第一，是不明原因的膀胱刺激症、尿结核杆菌培养阳性；

第二个，是有泌尿系统结核病的影像学证据，影像学证据包括有静脉肾盂造影、CT、b超等。静脉肾盂造影中可以出现肾乳头、肾小盏的虫蚀样变，肾乳头的小空洞行成，干酪样坏死，到晚期可以看到整个肾脏的钙化，多个肾盏的不显隐或者是大空洞，最后可能形成脓肾。CT对于钙化肾盏的扩张较为敏感，可以显示肾实质的疤痕和干酪样坏死。

第三个诊断标准是膀胱镜检查，膀胱镜检查会表现有典型的结核性膀胱炎的表现，和病理活检发现结核结节和肉芽肿形成。