三叉神经痛可以通过手术来根治，目前认为出现三叉神经痛的原因，是因为在三叉神经的根部，也就是三叉神经从脑干发出的区域，受到了血管的压迫，血管的搏动刺激三叉神经，引起三叉神经痛，大多数的责任血管是小脑上动脉。

手术的名称叫显微血管减压术，是开颅之后，在显微镜下找到三叉神经以及压迫它的血管，然后用一种特殊的材料放在两者之间，将两者分隔开，这样血管就不能刺激三叉神经，三叉神经痛也就消失了。