女性发生继发性的痛经，大部分是因为生殖系统的器质性病变导致的，部分继发性的痛经，是可以导致不孕症的出现，比如最常见的子宫腺肌症，继发性的痛经呈现进行性的加重，并且因为改变了宫腔内环境，可以造成不孕症的出现。

另外巧克力囊肿也可以导致不孕症的出现，女性患有粘膜下的子宫肌瘤时，可以诱发出现痛经现象，此外，因为粘膜下的肌瘤改变了宫腔内环境，有可能会影响到我们女性正常的受孕。