婴儿枕秃的治疗主要是针对引起枕秃的病因进行治疗，通常分为以下三个方面，首先，绝大部分婴儿枕秃是因为维生素D缺乏引起钙的吸收障碍出现缺钙，引起神经兴奋性增高，睡眠不安，头不断的摇动引起枕秃，那么在治疗上主要是补充维生素D3，适当补钙，多晒太阳。

其次，有少部分婴儿枕秃是营养加微元素缺乏，比如缺铁，那么主要是注意孩子的饮食，保证足够的能量需要，如果有缺铁的话，那么就需要适当补充铁剂治疗；第三种情况就是部分孩子可能存在神经系统基础疾病导致神经兴奋性增高，睡眠不安引起枕秃，那么就应该看小儿神经专科门诊，针对原发病进行治疗。