骶管囊肿的手术是有一定的风险的，比如会造成硬脊膜、脊髓和神经根损伤，导致患者的腰腿痛加重或者是长时间不能缓解。另外，骶管囊肿有手术后伤口感染的风险，比如手术后伤口出现红肿、渗液或者是脓性的分泌物的渗出，这个时候可能就有伤口感染发生，需要每天进行伤口局部的换药治疗，直到伤口的红肿消退，分泌物、脓液完全消失。