巧克力囊肿是属于子宫内膜异位症的一种表现，它是指具有生物活性的子宫内膜，也是由于经血逆流种植在卵巢表面，或者是盆腔的其他部位所导致的。在发生巧克力囊肿的时候，对于正常的怀孕是有一定的影响，容易发生抑制排卵以及卵巢输卵管不通，影响到正常的生育。在患有巧克力囊肿的时候，建议最好能够及时的进行手术的切除，积极的调理，手术后是可以正常怀孕的。