在患有子宫内膜异位症的时候，造成不孕的原因是非常复杂的，子宫内膜异位症，是由于具有活性的子宫内膜，在子宫腔以外的地方开始发展，对于卵巢的影响是比较大的。在卵巢发生子宫内膜异位症的时候，就会影响到卵巢正常的激素分泌以及排卵。另外，子宫内膜异位症，如果异位到了盆腔，还会影响到盆腔的黏连，输卵管的堵塞，导致输卵管的功能异常而发生不孕。子宫内膜异位症容易发生子宫的变形，即使受精卵形成以后，也会造成受精卵不能够正常着床，而发生不孕的。