这个手术最主要的后遗症就是复发，从医学的角度来看，舌下腺囊肿的根治性治疗是手术切除舌下腺囊肿，残留的囊壁不会导致复发。手术通常需要住院七天，出院一个月后基本愈合。

舌下腺囊肿手术一般没有后遗症，但是舌下腺囊肿手术不完全容易导致复发，舌下腺囊肿治疗后会有舌头不适，但不会损伤重要的肌肉和神经。