小婴儿如果患有脑积水，同时有咳嗽的话是可以同时治疗的。两者之间不并不冲突，如果有咳嗽的话都是提示有受凉、受寒，或者是有轻微肺部炎症的可能性较大。此时，因先去当地医院就诊，请儿科医师帮助判断目前的情况。可以适当地给予儿童使用一些化痰止咳平喘的药物来进行治疗，进行肺部听诊，若有明显的肺部感染则建议使用抗生素进行药物治疗，必要时可以配合做氧化雾化。对于婴儿的脑积水，则应行头颅CT或者核磁检查，判断目前脑积水的类型和严重程度，决定是否需要接受手术治疗。