对于脊髓空洞症患者来说，最主要的手术风险还是由于在手术过程中，出现的各种常见的手术风险，比如说麻醉意外，手术过程中遭遇到大出血的情况，或者由于变异的关系，导致需要手术术式发生改变，术后容易导致患者出现偏瘫、失语，甚至患者可能会造成长期植物生存状态。部分患者在接受手术治疗之后，可能会导致出现水电解质紊乱、低蛋白血症、肺部感染、泌尿系感染等各种合并症与并发症，相对来说，上述情况均属脊髓空洞症主要存在的手术风险。