相对来说脊索瘤属于低度恶性肿瘤，其生物学生长方式、生物学形态处于恶性肿瘤的生物学形态方式，生长速度较快，往往体积较大，由于其位置较为特殊，在发现的时候，多数已经处于疾病的晚期，因此很难做到手术完整切除。

残余的脊索瘤肿瘤细胞，会随着时间的推移逐步生长，从而造成复发的情况出现，一旦发生复发，则原有的脊索瘤生物学形态则会发生变化，出现恶性程度逐渐加重，并且生长速度逐步加快，给再次手术带来很大的困难。