对于发生脑干梗塞的患者，首先，急性期应该立即将患者送往当地医院就诊，行头颅CT或者核磁检查，帮助判断目前的情况。在急性期可以适当地给予患者使用一些健脑、活血化於、营养神经的药物，以改善脑皮层、脑干细胞缺血缺氧的状态。

如果患者有明显的颅神经功能障碍，比如有明显的吞咽功能障碍，或者出现了明显的肢体运动功能障碍，则应该在患者病情稳定的情况下，早期给予患者进行主动和被动的康复功能锻炼，有助于帮助患者改善症状， 尽可能地帮助患者改善预后。