菌血症是指致病菌侵入人体血液以后，人体防御机能将致病菌进行清除，没有产生毒素，则称之为菌血症。败血症是指致病菌侵入人体血液以后，机体防御机能不能将细菌清除，细菌在人体血液中生长繁殖，产生毒素，则称之为败血症。

菌血症预后较好，败血症预后较差，败血症的患者可出现全身的急性感染症状，出现多脏器功能障碍，严重的时候甚至可出现休克，危及生命，故败血症需要积极抗感染支持治疗。