月经结束以后，有褐色分泌物有可能是因为黄体功能不全。由于黄体功能不足，让黄体分泌的孕激素不足以支持分泌期间子宫内膜发育。

当然，除了黄体功能不全外，还可能是因为黄体萎缩不全，子宫内膜炎以及考虑有子宫内膜息肉等问题.

所以说，月经结束后有褐色分泌物，是妇科疾病发出的危险信号，虽然有时是正常的现象，但是当出现异常时，还是应当积极地做相关的检查和排查，切不可错过治疗妇科疾病的良机，平常还要保持良好的卫生习惯。