高密度脂蛋白是血液当中密度最大的一组脂蛋白，高密度脂蛋白跟外周胆固醇结合后，可以把胆固醇输送到肝脏进行代谢，因此能够清除外周组织的胆固醇，从而降低外周胆固醇的水平，因此具有抗动脉粥样硬化的作用。

在临床上一般通过检测血液里面高密度脂蛋白胆固醇来间接反映高密度脂蛋白的水平，如果血液当中高密度脂蛋白胆固醇升高，表明患动脉粥样硬化性心脑血管疾病的风险要低。如果血液当中高密度脂蛋白胆固醇降低，表明发生动脉粥样硬化性心脑血管疾病的风险会增高。