细菌性痢疾是由志贺菌属引起的肠道传染病，可有发热、腹痛、腹泻、里急后重、粘液脓血便，同时伴有全身毒血症症状，粪便培养志贺菌属阳性，阿米巴痢疾是由溶组织阿米巴寄生于结肠内，引起阿米巴痢疾或阿米巴结肠炎，属于寄生虫病。 通常在粪便中检查到阿米巴病原体为唯一可靠的诊断依据，从而鉴别细菌性痢疾或者是阿米巴痢疾。