肥厚性心肌病的治疗旨在改善症状，减少并发症和预防猝死。 其方法是通过减少流出道梗阻改善心室顺应性，预防血栓栓塞事件，识别高危猝死患者。 治疗需要做到个体化，主要治疗包括以下几方面：

一、药物治疗。药物治疗是基础，针对流出道梗阻的药物主要有受体阻滞剂和非二氢吡啶类钙通道阻滞剂。 当出现充血性心力衰竭时，需要采用针对性处理。 对房颤患者需要进行抗凝治疗，值得指出的是，对于胸闷不适的患者，在使用硝酸酯类药物时，需要注意除外流出道梗阻，以免使用后加重。

非药物治疗包括：一、手术治疗：对于药物治疗无效，心功能三到四级的患者，若存在严重的流出道梗阻，需要考虑行室间隔切除术。目前美国及欧洲共识将手术列入适合患者的首选治疗； 二、酒精室间隔消融术；三、起搏治疗。