核磁共振与CT的区别还是比较大的，虽然单纯从设备的外观来看，区别不是那么大，甚至看起来很是相似，但是它的工作原理是有非常大的区别的。

第一、核磁共振是依靠磁场来对人体进行检查的，而CT是利用X射线对人体进行检查，所以说核磁共振不存在X射线的这种辐射损伤，而CT是存在一定的辐射的。

第二、核磁共振对病人检查时的配合程度要求是比较高的，因为它的扫描速度是比较慢的，所以病人如果配合比较差的话，那么首选做CT，因为CT扫描速度非常快，如果病人配合的不是特别理想，图像受影响的程度也比较轻微一些。

再就是它们的优势部位不同，核磁共振的优势部位在于中枢神经系统，通俗来说就是大脑，而CT的最优势部位是肺部，肺部CT扫描比核磁共振扫描效果要好得多，而做头颅的话，核磁共振显示的效果要更理想一些。