头部做核磁共振检查是不痛苦的，当然可能会有一点声音，声音也可能会稍微大一点，但是相对来说，很少有因为噪声难以接受的。本身核磁共振检查，对人体是没有什么明显的不良作用的，也没有什么明显的不舒服的感觉。当然有的人，可能睁开眼睛时，由于空间比较密闭、比较狭窄一些，可能会觉得呼吸不太顺畅，不太舒服，但是只要你闭上眼睛，不要总是睁开眼睛去看，一般都是可以克服的。再有就是里面的声音，也都是在可以耐受的程度的，和在高速公路上听汽车的声音差不太多，分贝差不太多，这些都是可以耐受的。总的来说就是，做核磁共振头部检查可以认为是没有痛苦的。