对于月经规律的女性，月经周期28至30天一个周期，在停经39天的时候，通过B超大多数情况是可以看到孕囊的。

停经39天相当于孕五至六周，此时孕囊在宫腔内的直径大约一厘米左右，HCG数值应该大于2000。如果停经39天还未发现孕囊，要考虑排卵延迟的情况，可以通过监测HCG的数值来了解妊娠组织发育的情况。如果HCG大于5000仍未发现宫内孕囊，要考虑宫外孕或者妊娠组织发育不良的情况，需要进行定期监测HCG以及B超的情况。