孕39周有褐色的分泌物，首先要考虑是出现了见红，见红是临产的先兆，是由于子宫下段宫颈周围的胎膜与子宫壁之间出现了轻微的分离，毛细血管破裂可使阴道分泌物内混有血迹，这种情况一般在24至48小时后会出现临产。

有一些产前出血性的疾病，也可以导致出现褐色分泌物，例如前置胎盘、胎盘早剥，这时主要通过B超检查进行鉴别。还有少数宫颈病变例如宫颈癌，宫颈癌前病变以及宫颈息肉也会有类似情况的发生，可以通过阴道检查和孕妇既往的宫颈检查结果进行大致的判断。