如果孕酮低在早孕期间HCG能够正常增长，妊娠囊能够正常发育，其后期是胎儿的染色体检查，B超检查等方面没有明显异常，那么这种新生儿出生应该是健康的。这种早孕期的孕酮的大多是由于孕酮是一个脉冲性释放激素，通过血清学的检查并不能客观地反映孕酮在体内的情况，属于生理现象。

如果是病理性的孕酮低，大多是由于孕妇本人有某些内分泌方面的疾病，例如黄体功能不全、高泌乳素血症、多囊卵巢综合症以及甲状腺功能减退等，这种情况而导致的孕酮低只要进行及时的孕激素补充，对胎儿的远期发育也不会有明显的影响。