头疼是神经科症状里最大的非特异性症状，从脑内来说，就有很多的结构会引起疼痛，比如脑膜刺激、脑血管的收缩和舒张、颅内脑室系统压力增高、颅内敏感的带有痛觉神经结构的刺激，最常见的比如脑膜炎、脑室的扩张、偏头疼、血管问题以及颅内出血，都会导致明显的头疼，血压升高也会导致头疼。

再有一些神经刺激，比如吞咽的时候，耳朵里疼，这种是舌咽神经痛，还有面部的三叉神经分布区的三叉神经痛，除此之外一些面部的其他结构也会导致头疼，常见的有青光眼、鼻窦炎、中耳炎等，有时也会引起头疼的发作。