肛周脓肿切开引流后，绝大多数会形成肛瘘。而传统的肛周脓肿根治术切口相对较大，术后可能会有以下并发症：

一、疼痛，肛周神经丰富，对刺激敏感，术后会局部形成瘢痕，可能会有阵发性的针刺样疼痛或胀痛。随着时间推移，瘢痕软化，肛门不适症状会逐渐降低；

二、出血，肛周血运丰富，术后创面容易被各种因素刺激，导致少量出血，如大便干结、内裤或者纸的摩擦。等创面完全愈合以后，出现出血的现象就完全消失。但是如果出现大量出血，应及时去医院就诊，查明原因；

三、肛门损伤，肛周脓肿多数是因肛腺感染引起的，如不及时治疗，就会沿着各间隙蔓延，感染跨过括约肌，手术可能会造成肛门括约肌的损伤；

四、愈合时间长，肛周脓肿脓液常常涉及多个直肠肛管间隙，切口大时，愈合时间也长。