川崎病的病因目前尚不明确，许多流行病学资料提示，有多种病原菌，比如说葡萄球菌、链球菌、支原体、还有立克次体以及某些病毒等感染，可能与川崎病的发生相关，当然也可能与环境、遗传基因等因素相关。

总之，川崎病是一个发病机制尚不明确的疾病，可能是由多种因素所导致的一种自身免疫性反应，从而引起的一组以全身性血管炎为主要病变的临床综合征。