巧克力囊肿会对患者正常的怀孕产生一定影响的,这也是需要看患者囊肿的大小,是否影响排卵等情况综合诊断的。如果巧克力囊肿比较小,或者是单侧囊肿,囊肿大小在3厘米以下,这种情况是不影响怀孕的。但是如果囊肿比较大,超过5厘米,则会影响受孕,甚至还可能会引起流产。因此,对于这种情况,需要先腹腔镜手术治疗囊肿,再用上3个月的药。如果时间比较长,巧囊会粘连的比较严重,受孕是受影响的。