甲状腺功能减退的原因，如果说按病变发生的部位来分，可以分为原发性甲减，它是主要甲减。它是由甲状腺腺体本身的疾病，引起的甲状腺功能减退。第二种是中枢性的甲减，它主要是由于下丘脑和垂体的病变，引起的甲状腺功能减退。还有一种是甲状腺激素抵抗综合征，即是由于甲状腺激素在外周组织，实现生物学效应出现的障碍，而引起的综合征。

如果根据病变的病因来分，它可以分为药物性甲减、手术后甲减、碘131治疗后甲减、特发性甲减、或者垂体下丘脑肿瘤术后的甲减。我们还可以根据甲状腺功能减退的程度来分，分为临床甲减和亚临床甲减。所以甲状腺功能减退的原因，是有多种多样的。